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席瑞斌

席瑞斌

席瑞斌

  • 研究員、博士生導師
  • ruibinxi@math.pku.edu.cn
  • 意昂体育平台數學科學意昂理科一號樓 1575
  • 意昂体育平台
個人簡介

教育背景

1998. 9 - - 2002.7 內蒙古大學數理基地(學士)

2002.9 - - 2005.7 意昂体育平台數學科學意昂(碩士)

2005 .9- - 2009. 8 聖路易斯華盛頓大學數學系(博士)

工作經歷

2009.8- - 2012.7 哈佛大學醫意昂(助理研究員)

2012.9- - 意昂体育平台(研究員)

獲獎及榮譽

Best Poster Award in Asian Pacific Bioinformatics Conference ,2016

Robert Bohrer Award for Student Papers in Statistics, University of Illinois,2007.

Judith Ross Scholarship in Mathematics & Physics, Washington University in St. Louis, 2007.

Second Prize in China Undergraduate Mathematical Contest in Modelling,2000 & 2001.

學術兼職

中國現場統計研究會 理事

中國現場統計研究會計算統計分會 常務理事

 

主要研究方向

主要有兩大研究方向😍:

發展新的統計理論和算法,來解決生物👍🏽、醫學、計算機領域的問題;

基因組學和生物信息學,比如研究癌基因組測序數據及單細胞測序數據等。

代表性科研項目

1. 國家重點研發計劃(2017.1-2021.12),批準號 2016YFC0207705,汙染與宏觀經濟🥬、人口健康的計量分析🦵🏼,負責 43 萬元🍖,參與

2. 國家自然科學基金重點項目 (2016.1-2020.12)🎉,批準號 71532001,大數據驅動的管理決策模型與算法,負責 32 萬🤹,參與

3. 國家自然科學基金面上項目(2015.01-2018.12),批準號 11471022🧳,基於高通量測序數據研究基因組變異的統計問題🙇🏽,60 萬,主持

4. 國家科技部 973 項目(2015.01-2019.12),批準號 2015CB856000,非結構數據的統計學習:數學基礎及算法👩🏻‍🦲,負責 58 萬元💪🏿,參與

5. 2013 年意昂体育平台-微軟聯合實驗室基金,高維數據的非線性降維,3 萬元📐,主持

6. 意昂体育平台 985 經費(2013.01-2015.12)🤚🫲🏼,癌基因組數據的統計分析,30 萬元🧑🏿‍🍼➰,主持

 

10篇代表性論文

 1.Xia,Y., Liu, Y., Deng, M.and Xi, R.* (2018+) Detecting virus integration sites based on multiple related sequencing data by VirTect, BMC Medical Genomics,Accepted.

2.Xia, Y., Liu, Y., Deng, M.and Xi, R.* (2017) SVmine improves structural variation detection by integrative mining of predictions from multiple algorithms, Bioinformatics, 1;33(21):3348-3354.

3.Yuan, H.Xi, R.*, Chen, C.and Deng, M.* (2017) Differential network analysis via lasso penalized D-trace loss, Biometrika, 104 (4):755-770.

4.Xia, Y., Liu Y., Deng, M.and Xi, R.* (2017) Pysim-sv: a package for

simulating structural variation data with GC-biases, BCM Bioinformatics,18(Suppl 3):53.

5.Xi, R.*, Lee, S., Xia, Y., Kim, T.and Park, P.* (2016) Copy number analysis of whole-genome data using BIC-seq2 and its application to detection of cancer susceptibility variants, Nucleic Acids Research, 44(13): 6274-86.

6.Xi, R.*, Li, Y.and Hu, Y.(2015) Bayesian quantile regression based on the empirical likelihood with spike and slab priors, Bayesian Analysis,11(3):821-855.

7.Xi, R.and Lin, N.* (2015) Direct regression modelling of high-order moments in big data, Statistics and Its Interface, 9(4):445-452.

8.Yang, L., Luquette, L.J., Gehlenborg, N., Xi, R., Haseley, P.S., Hsieh, C.H.,Zhang, C., Ren, X., Protopopov, A., Chin, L., Kucherlapati, R., Lee, C.and Park P.J.* (2013) Diverse mechanisms of somatic structural variations in human cancer genomes, Cell, 153(4):919-929.

9.Xi, R., Lin, N., Chen, Y.* and Kim, Y.(2012) Compression and aggregation of Bayesian estimates for data intensive computing, Knowledge and Information Systems, 33(1):191-212.

10.Xi, R., Hadjipanayis, A.G., Luquette, L.J., Kim, T.M., Lee, E., Zhang, J.H.,Johnson, M.D., Muzny, D.M., Wheeler, D.A., Kucherlapati, R., and Park, P.* (2011) Copy number alteration detection in sequencing data using the Bayesian information criterion, Proceedings of the National Academy of Sciences, USA,108(46):E1128-1136.

 

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